Il servizio in background sincronizza senza che la finestra del programma debba essere aperta – anche quando nessuno ha effettuato l'accesso. Usa lo stesso file di configurazione del programma, quindi le stesse sincronizzazioni con le stesse opzioni.
Il menu Servizio in background contiene Avvia e Arresta. Con Visualizza → Background si vede se il servizio è in esecuzione in quel momento.
Il pacchetto di installazione consente all'utente con cui gira il servizio di avviarlo e arrestarlo senza password di amministratore. Agli altri utenti viene chiesta la password di un amministratore.
Servizio e programma non si intralciano: sincronizza sempre solo uno dei due, così due esecuzioni non toccano mai gli stessi file contemporaneamente. Se nel programma si sceglie Avvia mentre il servizio sta lavorando, il servizio si fa da parte.
Il servizio legge il file di configurazione. Poiché il programma salva subito ogni modifica, un servizio in esecuzione la recepisce da solo: interrompe l'esecuzione in corso e ricomincia con la nuova configurazione. Solo se il salvataggio non è riuscito il titolo della finestra mostra (non salvato) e il servizio continua a lavorare con lo stato precedente; all'avvio del servizio il programma chiede allora se salvare – Annulla non avvia il servizio.